近年來遠赴中國大陸工作的台商愈來愈多，他們離鄉背景討生活的目的，正是全家的幸福與平安。民國92年，在台南新化地區發生了一起滅門血案，對象正是在廣州經商的男子，他在老家的妻子、孩子，全在一夜之間變成了刀下亡魂，究竟是什麼血海深仇，讓歹徒痛下毒手，甚至於對襁褓中的嬰兒，也不放過呢？「關鍵時刻」根據本案改編成離奇，卻又情感充沛的好戲－他是我的囝仔。
　　
男主角吳俊富（劉明仁飾）在台灣原本是網咖店的老闆，由於同業競爭激烈，經營不善，必須結束營業。他的太太王彩鳳（洪譽軒飾）為了俊富的未來，以及家庭的生計，特別跟自己的長兄遊說，同意讓俊富到哥哥設在中國的工廠，開一間員工餐廳，於是俊富在彩鳳的牽線下，半年前即赴廣州準備開店事宜。

不料當俊富從中國返回台灣時，迎接他的不是溫暖的家，是彩鳳躺在家中，冰冷的屍體，還有溺死在浴室，不滿周歲的兒子，以及在醫院裡跟死神搏鬥的女兒－萱萱（陳芷婷飾），這是所有在異鄉打拚的人，最不願意見到的結果。

刑警阿信（王信翔飾）陪同俊富來到醫院探望女兒，雖然她的傷勢獲得控制，但是醫生卻告訴俊富，萱萱是白血病患，這次受傷流血不止的原因，就是過多不成熟的白血球，吞噬了正常的血小板，導致凝血困難，這種病症可以靠著移殖骨髓，讓萱萱恢復造血功能，但是適當的骨髓難求，俊富聽後，率先表示願以自己的骨髓與萱萱進行比對，畢竟萱萱現在是唯一活下來的親人了。

阿信從俊富過往的員工開始過濾，其中一名員工曾文彬（鄭景仁飾）是彩鳳從小玩到大的鄰居，阿信發現文彬所說的彩鳳，和俊富口中的賢妻良母大不相同，因為在俊富出外工作這段期間，他是安慰彩鳳寂寞空閨的男人。

為了救萱萱，院方積極比對俊富父女骨髓，卻沒想到兩人的DNA竟然顯示出沒有血緣關係，這個結果震撼了俊富，在他失去妻小之後，命運又跟他開了一個大玩笑，萱萱的父親是誰？俊富檢查了彩鳳的手機，發現一個重複的號碼，那個人就是久未露面的邱志偉（許子乃飾），他是彩鳳的老情人，也是俊富的大學死黨，志偉和彩鳳的死有關嗎？萱萱的父親是文彬？是志偉？還是另有其人呢？一個幸福的家庭裡，竟然有著諸多不為人知的祕辛，真相到底是什麼？ 3月13日敬請準時收看「關鍵時刻」！